①洪涝灾害中，大量动物因灾死亡，随着气候转暖，动物尸体腐烂，容易造成口蹄疫、高致病性禽流感、高致病性猪蓝耳病、猪链球菌病、钩端螺旋体、炭疽等多种动物疫病的发生和流行。
②原因：一是饲养环境大不如以前。强降雨过后，畜禽舍大量毁损，防疫设施受损。二是病原易大量扩散。大量畜禽因灾死亡，病原微生物在尸体上滋生，同时，土壤中的大量病原微生物被暴露，易污染水源等环境。三是畜禽免疫力下降。洪灾过后，大部分畜禽抵抗能力下降，容易受到疫病侵袭，需按要求和免疫程序加强免疫。一些在正常年份不易发生的疫病，如炭疽病、猪链球菌病等也可能发生。
一是及时无害化处理死亡的畜禽。
二是对饲养场内外环境和屠宰场、交易市场和畜禽尸体处理等场所消毒。
三是加强免疫接种；四是加强饲养管理，确保畜禽饲料和饮水安全，确保养殖环境清洁卫生。
一是尽快帮助受灾养殖场（户）恢复生产、减少损失，做好技术指导、防疫知识的宣传培训。
二是强化消毒，指导无害化处理。指导督促养殖场（户）、做好环境消毒和动物尸体的无害化处理。
三是加强疫情监测，及时报告和处置突发疫情。要强化应急工作，按照应急预案和防治技术规范处置突发疫情。
四是加强检疫监督，严防病死畜禽流出。严厉打击贩卖病死动物及其产品的行为。一方面保证进出受灾的动物及其产品顺畅调运，另一方面要保障动物防疫秩序，防止疫情跨区域传播。
五是加强灾后免疫，协助恢复畜禽生产。
最简单有效的处理方法是深埋，深埋应选择高岗地带，坑深在2米以上，尸体入坑后，撒上石灰或消毒药水，覆盖厚土。有条件的地方可以进行焚烧处理，或直接投入无害化处理池。
一是对倒塌的圈舍消毒，重点是对死亡动物的和圈舍进行原地消毒。
二是对可继续使用的养殖场消毒，大型养殖场要定期清扫，定期用化学药物消毒，保持圈舍清洁和环境卫生，防止野生动物侵入，消灭老鼠和蚊蝇。小型养殖场及散养户，重点是经常性地清扫圈舍和处理粪便，保持清洁。如有疾病发生，就要用化学消毒药品消毒。
三是对重建的圈舍消毒，除按常规消毒外，灾后还应根据疾病的流行情况增加消毒次数，选择合适的消毒药品。有条件的地方，建立沼气池，发酵处理粪便，防止蚊蝇滋生。
一是保证消毒频率。灾后环境至少每周消毒两次，圈舍可带畜禽每周消毒3次-4次。一旦发生疫情，则要增加消毒次数，并且要对消毒效果进行监测。
二是保证消毒药物的有效浓度。
三是消毒前要保持圈舍和环境的清洁卫生。
四是防止在消毒过程中对环境造成污染。
五是发生重大动物传染病，如高致病性禽流感、口蹄疫、猪瘟和高致病性猪蓝耳病等后，必须严格按照农业部应急处理预案处理。
由于连降大雨，易引起饲料霉变。霉饲料中霉菌能引起动物中毒。中毒后，一般动物体温正常，粪便干燥，有呕吐症状。母猪不孕并有流产现象。有的出现神经症状，严重的出现死亡。全身多处部位包括内脏出血，肝脏有坏死。霉菌饲料中毒没有有效治疗方法，重在预防，严禁饲喂腐败、变质或霉变的饲料。注意饲料的保质期，防止食用过期饲料。
灾害极易造成疫病流行，一些多年不发生或很少发生的疫病，如猪丹毒、猪肺疫、猪链球菌病等炭疽病，也有可能发生。灾后畜禽抵抗力下降，不易产生坚强的免疫力。对没有进行口蹄疫、猪瘟、鸡新城疫和高致病性蓝耳病免疫接种的畜禽，要立即补免。对已进行了免疫接种的畜禽，根据免疫抗体检测情况及周边疫情情况，必要时强化免疫一次。因此，当前必须突击抓好畜禽免疫工作。对其他畜禽传染病，也要根据疫情动态，做好预防接种工作。
四不准是“不准宰杀、不准食用、不准出售、不准转运病死畜禽及其产品”，一处理是“对死亡畜禽必须进行无害化处理”。
一要尽快疏通养殖场的排水通道，排除畜舍内的积水，修复加固破损的畜舍，不能及时修复的，尽快将畜禽转移至干燥安全地带。
二要创造良好的饲养环境，保持畜舍内的卫生，及时清理粪便，做好通风工作。
三要供给营养丰富的饲料和清洁的饮水。饲料要少添勤喂，避免发霉。在饮水中可加入复合维生素B和Vc，增强畜禽抵抗力，消除应激。
四要对低龄、体弱、伤残、病情严重的畜禽及时淘汰，降低饲养成本。商品畜禽达到出栏标准的要尽快出栏，降低饲养密度。
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