在自然条件下，麝鼠的营养代谢可分为3个时期，即繁殖期（4月~9月）、准备过冬期（10月~11月）和过冬期（12月至翌年3月）。此外，在仔麝鼠生长过程中，还有育成期，从断乳到育成大约需要3个月。冬天麝鼠的营养代谢处于低水平，即处于维持状态，这时不同月龄的麝鼠所消耗的总热能基本相同，每公斤体重产热平均为394.1千焦，或每只麝鼠产热543.9千焦~585.8千焦。到繁殖期能量消耗增加，雄麝鼠产热可提高1倍，雌麝鼠产热可提高0.6倍~0.8倍。
麝鼠在繁殖期对蛋白质的需要量较高，每100克干物质中需含20克左右的蛋白质，而冬季大约需要8克~12克。秋季第二、第三窝的幼龄麝鼠应保持夏季时期的营养水平。在全年各时期的日粮中，粗脂肪不要超过干物质的3.7%，春季和夏季粗纤维不要超过饲料日粮配方的30%。在自然条件下，冬季日粮中也不应含有高蛋白和高脂肪，以免动物过肥。试验证明，粗料中干物质消耗为饲料日粮配方的1倍，对麝鼠的生育是无益的。
全年日粮中无机盐成分没有大的变化，钙磷比近于1∶1，每100克日粮干重含0.4克钙和0.66克磷，此外，还含42毫克锰、1.1毫克铜、31.1毫克锌和4.6毫克铁。
3月份~4月份，按麝鼠每公斤体重喂干草90克，杨、柳树枝和树叶对麝鼠的繁殖和提高仔麝鼠成活率有良好的作用。繁殖期投喂动物性饲料是十分必要的，在自然条件下，可以喂给软体动物；在笼养条件下，每日每只供应5克~10克动物性饲料。
冬季麝鼠处于低耗阶段，这个时期要保证麝鼠安全越冬，为翌年的繁殖打下基础。其管理要点是，絮草保温要充足，饲料蔬菜投喂要及时，定期观察要坚持。在北方，室外的温度可达-30℃左右，为了保证麝鼠安全越冬，要将窝室及水池和运动场均放满干草，干草中不能有发霉草掺入，因防寒的干草也是麝鼠冬季的饲料，保证干草的质量尤为重要。必要时可搭建塑料大棚防寒，确保冬季有较高的成活率。冬季麝鼠数量要根据吃食的情况而定，精饲料、青饲料每天要投喂，杨柳树枝每周喂一次，掌握麝鼠的动态。
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