菠萝含有一种叫“菠萝朊酶”的物质，能分解蛋白质，帮助消化，溶解阻塞于组织中的纤维蛋白和血凝块，改善局部的血液循环，稀释血脂，消除炎症和水肿，能够促进血循环。尤其是过食肉类及油腻食物之后，吃些菠萝更为适宜。菠萝蛋白酶可以把动物肉的大分子蛋白质水解成小分子肽或氨基酸，不但能使肉变得更嫩，还能提高蛋白质的利用率，更有利于人体的消化和吸收。所以菠萝特别适合跟牛肉、猪肉、鸡肉等肉类一起做菜，菠萝蛋白酶可以起到肉质嫩化剂的作用，因此，菠萝可以作为安全的水果“嫩肉粉”。无论是在炖还是炒肉类菜肴，烹制前都可以榨取或挤压部分菠萝汁进行腌制。如果想保持菠萝的口感，可以在肉八九成熟时将其放入。此外，如果感觉吃肉太油腻，可吃些菠萝，能开胃顺气、解油腻。
一部分人吃菠萝后会发生过敏的情况，过敏反应最快可以在15分钟内发生，这样的症状被称为“菠萝病”或者“菠萝中毒”，比如腹痛、腹泻、呕吐、头痛、头昏、皮肤潮红、全身发痒、四肢及口舌发麻，过敏比较严重的还出现呼吸困难、休克等反应。这是因为菠萝蛋白酶对人们口腔黏膜和嘴唇的幼嫩表皮有刺激作用，如果吃菠萝前不用盐水泡，会让人有一种麻痹刺痛的感觉。因此应将果皮和果刺修净，将果肉切成块状，在稀盐水或糖水中浸渍，浸出甙类，然后再吃。用盐水泡菠萝后，能够有效破坏“菠萝朊酶”的内部导致过敏的结构，从而失去使人过敏的能力，并减轻对于人体的毒性。
