苍蝇从幼虫到成虫均生活在杂菌横生的环境里，以机械性传播和生物性传播两种方式在人类和其他动物之间传播多种疾病，如痢疾、伤寒、霍乱等，而其自身却很少生病，即使在高密度人工饲养的条件下也不会发生大规模传染病而死亡，说明苍蝇有其独特的免疫防疫机制，比一般昆虫能更有效地抵御病原菌的感染。但由于苍蝇个体较小，所以抗菌肤研究不及麻蝇，且不如经济类昆虫研究的全面和深人。

苍蝇抗菌蛋白的抗菌机理是作用于细菌细胞膜。对数种细菌的抗菌活性检测表明，苍蝇抗菌蛋白具有较广的抗菌谱，对人病原细菌（大肠杆菌、绿脓杆菌和金黄色葡萄球菌）、昆虫病原细菌（类产碱假单抱菌和苏云金杆菌）及非病原细菌（枯草杆菌和地衣芽孢杆菌）都有抗性，对革兰氏阳性菌的抗性高于革兰氏阴性菌。8×10¯６摩尔/升的苍蝇抗菌蛋白对大肠杆菌的抑菌活性即达到了与2×10¯３摩尔/升的丁胺卡那霉素相同的效果。这从一个侧面反映出该抗菌蛋白高效的特点。王香萍等对从苍蝇幼虫体表提取的物质进行了分离纯化、抑菌机理、稳定性、化学成分等方面的研究，结果发现从苍蝇幼虫体表提取的其分泌的抗菌活性物质，在一定浓度下低温时易于结晶，晶体为多边形。具有抑菌活性的各部分占初提物的比例分别为1.24％、0.1％、90.46％、2.46％。各部分抑菌活性大小不同，以无水乙醇萃取活性较高。从苍蝇幼虫、蛹壳壳表面均可提取抗菌物质，卵壳表面较小，抗菌物较少则难提取出抗菌物质，从苍蝇幼虫、蛹及剩余饲料中提取抗菌物的粗提物占其原料的比例分别为0.07％、0.02％、0.62％。

提取的抗菌物质抑菌谱广，对测试的病原菌均有良好抑制效果。对12种如水稻纹枯等病原真菌有显著抑制效果，对玉米大斑病菌等3种作物病原真菌有良好抑制效果；对7种作物病原细菌有显著抑制效果；对7种动物细菌有显著抑制效果。对真菌作用36小时此抗菌物引起真菌菌丝顶端原生质外渗，72小时后菌丝丛生，分支加剧，呈簇状。