近年来渔业生产供给市场一直较好，但也出现了捕捞产能严重过剩、品种品质不高、渔业资源持续衰退等问题。以长江流域为例，这里分布了鱼类370余种，其中170种是长江特有的鱼类，多数受到生存威胁，其中白鳍豚、白鲟已经灭绝，中华鲟和江豚等极度濒危，农业部数据显示，青鱼、草鱼、鲢鱼、鳙鱼这长江四大家鱼从占渔获物的80%降至目前的14%，产卵量也从300亿尾降至目前不足10亿尾，仅为原来的3%。据中国水产科学研究院淡水渔业研究中心的资料，长江刀鱼历史上最多时曾经占到长江鱼类捕捞量的35%以上，如今每年产量仅几十吨。
目前，长江年淡水捕捞量仅为约10万吨，不足最高年份的1/4。近海渔业的过度捕捞问题是渔业资源发展不可持续的原因之一，我国管辖海域的渔业资源可捕捞量大约是800万吨到900万吨，而实际的年捕捞量在1300万吨左右，由于过度捕捞和环境因素的影响，我国近海鱼类产卵地遭到了严重的破坏，海洋渔业资源严重衰退，东海无鱼已经成了事实，其他海域也在一定程度上出现了无鱼可捕的情况。
农业部部长韩长赋表示，当前渔业的问题不是量的问题，而是品种质量问题，是渔业资源的问题，是生态环境的问题，要重点做好资源保护和减量增收两方面的工作。
