根据口蹄疫防治计划提出的目标，到2020年，全国亚洲I型口蹄疫达到非免疫无疫，A型口蹄疫免疫无疫；O型口蹄疫海南岛、辽东半岛、胶东半岛非免疫无疫，辽宁（不含辽东半岛）、吉林、黑龙江、北京、天津、上海免疫无疫，全国其他地区维持控制标准。口蹄疫防治能力明显提升，全国省、市、县三级兽医实验室 O型、亚洲 I型、A型口蹄疫监测工作全面开展，有效防范境外变异毒株和 C型、SAT1型、SAT2型、SAT3型口蹄疫传入。
根据高致病性禽流感防治计划提出的目标，到2020年，全国所有种禽场达到净化标准；生物安全隔离区和海南岛、辽东半岛、胶东半岛达到非免疫无疫标准；北京、天津、辽宁（不含辽东半岛）、吉林、黑龙江、上海、山东（不含胶东半岛）、河南达到免疫无疫标准；其他区域维持控制标准。高致病性禽流感防治能力明显提升，在巩固H5亚型高致病性禽流感防控效果的基础上，建立健全H7亚型高致病性禽流感风险防范、监测预警和应急处置机制，有效防范 H7亚型禽流感风险，有效保障养禽业生产安全、家禽产品质量安全和公共卫生安全。
