主要虫害有黄守瓜、蚜虫和红蜘蛛等，对这些害虫秋季的防治方法应以防为主，治为辅，防又以“赶”为主。其方法是在每天上午9时左右，配制只需有农药气味的低浓度药液喷洒瓜叶上，使害虫嗅觉到药的气味后不迁移到瓜田来危害，如果下午4时左右用上述方法重复一次，驱虫的效果更好。虫害发生严重时，要参照“西瓜、甜瓜病虫害防治”及时防治。
近几年生产实践证实，瓜绢螟对秋季西瓜生产危害严重。瓜绢螟又叫瓜野螟，在华中地区一年发生5代，以老熟幼虫或蛹在枯卷叶中越冬。一般在5月初出现成虫，5月下旬至6月幼虫在黄瓜上危害，继而危害丝瓜、苦瓜、冬瓜，一年中以7-9月危害最重。成虫白天躲藏，夜间出来活动，趋光性不强，卵产于叶背，散生或者几粒在一起，初孵出的幼虫在叶背吃食叶肉，3龄后吐丝缠叶，躲在里面危害，还能蛀入瓜藤、幼果和花心进行危害。主要防治方法：虫少时可摘除卷叶，捏死幼虫。由于瓜野螟对秋西瓜为害方式比较特别，一般的农药难以达到防治效果。武汉大学生命科学院生产的生物农药Bt麸子粉对防治瓜野螟效果显著。使用方法是：在盛有28斤水的容器中，用手将袋装麸子粉在水里反复搓揉，然后将药液倒入喷雾器中对西瓜叶面进行喷施，喷药当天，瓜野螟便开始拒食，2-3天后死亡。连续晴天，药效可持续10天以上。湖北省农科院Bt研究开发中心湖康欣农用药业有限公司研制的阿维？毒24%乳油，配制3000-4000倍水溶液喷雾，效果同BT麸子粉，并还可兼治蚜虫和红蜘蛛。
