温度调节。一是缓苗期。通常为9月下旬，栽后5天―7天密闭大棚增温促苗活棵，棚内日温维持在30℃―35℃、夜间13℃以上；二是结果前。缓苗后应恰当通风，使棚温维持在28℃―30℃，高于30℃应放风降温、低于25℃时停滞通风；三是结果期。10月上旬以后，当夜温降到10℃以下时应在棚内加盖小拱棚；11月中旬后，为避免冻害，夜间应在小拱棚上加盖草苫保温，使夜温不低于15℃，白天通常维持20℃―25℃的适温；四是寒冬期。通常在12月中旬落伍入严寒冬季，应闭棚保温，草苫要晚揭早盖，使小拱棚内温度白天维持在22℃―27℃、夜间在13℃以上。
调肥控水。开花期应进行3次―4次中耕松土培根，中耕深度6cm、培土总高度12cm，并少浇水或不浇水；在门椒和对椒采收后，分别浇一次水和施一次肥料，每亩每次施硫酸氨15kg＋过磷酸钙15kg＋生物钾肥150ml（或草木灰60kg），在株间打洞深施或穴施效果好；在四门斗、八面丰姿收后和满天星期，应浇水施肥4次，每次施肥量要逐步增长，通常第一次施三元复合肥（氮、磷、钾三因素比例为15：15：15）10kg；第二、第三次分别为15kg；第四次施不超过20kg。
植株调整。门椒坐住后，其以下的侧枝应及时打去和抹掉，并应经常摘除植株下部的病叶和老叶；在四门斗采收后，为防植株倒伏，便于通风透光及田间操作，应搭架固定；开春后，若更新复壮植株，应将四门斗以上的枝条留2个节剪去，同时加强追肥浇水，促新枝生长发育及开花坐果。
防落花落果温度较低或温度变幅较大会引起秋延迟辣椒落花落果；应于开花前后的晴天上午10时前，用30PPM辣椒灵或西红柿灵喷花。
防病治虫。大棚秋椒主要病害为疫病、灰霉病、病毒病等，可分别用50％扑海因1000倍液、50％速克灵1500倍液、20％植病灵Ⅱ800倍液，于活棵后每隔10天―15天，交替喷雾防治4次―6次；虫害主为茶黄螨和蚜虫等，可分别用三氯杀螨醇、敌杀死等800倍―1000倍液防治。
适时采收。当外界气温过低、大棚内辣椒不能延续生长时，应及时采收，免得果实受冻，产生裂果或浆果等；也可依据市场行情，于元旦或春节前后分批上市或一次性收获供给节日市场。
