出血病与肠炎病。两种病均主要危害当年的一龄草鱼种，病鱼肛门红肿，肠道充血呈鲜红色，但出血病由呼肠弧病毒引起，而肠炎病是由细菌引起的肠道充血发炎，严重的呈紫色，剖开肠道无食，有脓血，观察体表，鳍条被蛀蚀，腹部膨大，挤压有黄色黏液从肛门流出。
鳃霉病与烂鳃病。草鱼多患这两种病，病鱼头部乌黑，鳃丝苍白。但鳃霉病病鱼的鳃丝肿大、发炎，而烂鳃病则出现鳃组织腐烂、崩溃，鳃丝软骨外露，甚至腐蚀鳃盖内表皮形成“天窗”，鳃上常粘有污泥。
白点病与打印病。相同点是病鱼体鳍条上均匀布满白点，严重时鱼体表似覆盖一层白色薄膜，水温在15℃~25℃时为流行季节。而打印病的白点之间可见充血斑点，严重时白点连片重叠，像裹了一层米粉，该病易发生在偏酸性水域中。
白头白嘴病与车轮虫病、钩介幼虫病。多发生于夏花草鱼苗，病症是鱼吻端呈白色，唇始终张，口张闭失灵。不同点是：白头白嘴病表现为鱼眼球以前的皮肤变白，吻端皮肤因感染而腐烂；车轮虫病头部呈白色外，鳃、鳍条、体表可见红色胞囊，剖开胞囊内有钩介幼虫。
泛塘与中毒。二者都是鱼在短期内大量死亡。泛塘一般发生在雷阵雨后或长期阴雨绵绵的早晨，而中毒发生在任何时候。泛塘是因水中严重缺氧而窒息死亡，死前除鲤、鲫鱼外，均上浮水面狂游乱窜，头撞岸边，先呈奄奄一息状态，随后陆续死亡。中毒则是全塘或者塘的某一区域所有鱼上浮水面，全身强烈颤动、痉挛和阵发性冲撞，随后失去平衡，仰游滚动，慢慢沉入水底，呼吸微弱而死亡。 （水百）
